MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 74614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009428	AAG	2	6	72	77	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276059
2	NC_009428	CGC	2	6	101	106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
3	NC_009428	CCG	2	6	119	124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
4	NC_009428	CGG	2	6	181	186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276059
5	NC_009428	GCC	4	12	189	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
6	NC_009428	TCC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276059
7	NC_009428	CGC	2	6	317	322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
8	NC_009428	GCT	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276060
9	NC_009428	CGA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276060
10	NC_009428	TGGCG	2	10	973	982	0 %	20 %	60 %	20 %	146276060
11	NC_009428	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276060
12	NC_009428	CGCCTG	2	12	1046	1057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146276060
13	NC_009428	CGC	2	6	1107	1112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
14	NC_009428	CGC	2	6	1116	1121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
15	NC_009428	AGG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
16	NC_009428	GCCC	2	8	1160	1167	0 %	0 %	25 %	75 %	146276060
17	NC_009428	TCG	3	9	1230	1238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276060
18	NC_009428	GCC	3	9	1262	1270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
19	NC_009428	CGC	2	6	1271	1276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
20	NC_009428	G	6	6	1286	1291	0 %	0 %	100 %	0 %	146276060
21	NC_009428	GGC	2	6	1322	1327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276060
22	NC_009428	TGGGC	2	10	1330	1339	0 %	20 %	60 %	20 %	146276060
23	NC_009428	GC	3	6	1392	1397	0 %	0 %	50 %	50 %	146276060
24	NC_009428	GCGCGA	2	12	1450	1461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146276060
25	NC_009428	GAT	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276060
26	NC_009428	AGG	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
27	NC_009428	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276060
28	NC_009428	GAG	2	6	1643	1648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
29	NC_009428	GCC	2	6	1659	1664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
30	NC_009428	GTG	2	6	1679	1684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276060
31	NC_009428	CCGA	2	8	1694	1701	25 %	0 %	25 %	50 %	146276060
32	NC_009428	GCA	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276060
33	NC_009428	GAG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
34	NC_009428	ACA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276060
35	NC_009428	CGCC	2	8	2032	2039	0 %	0 %	25 %	75 %	146276060
36	NC_009428	CGCT	2	8	2081	2088	0 %	25 %	25 %	50 %	146276060
37	NC_009428	CGG	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276060
38	NC_009428	ACCAC	2	10	2121	2130	40 %	0 %	0 %	60 %	146276060
39	NC_009428	CATG	2	8	2134	2141	25 %	25 %	25 %	25 %	146276060
40	NC_009428	GAG	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
41	NC_009428	GAC	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276060
42	NC_009428	GCC	2	6	2208	2213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
43	NC_009428	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276060
44	NC_009428	GCG	2	6	2363	2368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
45	NC_009428	GTCG	2	8	2397	2404	0 %	25 %	50 %	25 %	146276061
46	NC_009428	GCG	2	6	2409	2414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
47	NC_009428	GGT	2	6	2499	2504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276061
48	NC_009428	GGT	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276061
49	NC_009428	CGA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
50	NC_009428	CGG	2	6	2552	2557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
51	NC_009428	TGC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
52	NC_009428	GC	3	6	2594	2599	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
53	NC_009428	TGACGG	2	12	2636	2647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146276061
54	NC_009428	CCGG	2	8	2648	2655	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
55	NC_009428	GGA	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
56	NC_009428	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
57	NC_009428	GAG	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
58	NC_009428	CATG	2	8	2823	2830	25 %	25 %	25 %	25 %	146276061
59	NC_009428	GAG	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
60	NC_009428	TGC	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
61	NC_009428	CGAC	2	8	2870	2877	25 %	0 %	25 %	50 %	146276061
62	NC_009428	CG	3	6	2889	2894	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
63	NC_009428	GAAC	2	8	2961	2968	50 %	0 %	25 %	25 %	146276061
64	NC_009428	CTC	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276061
65	NC_009428	GAC	3	9	2983	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
66	NC_009428	CGC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276061
67	NC_009428	CG	3	6	3095	3100	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
68	NC_009428	GCG	2	6	3120	3125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
69	NC_009428	CGA	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
70	NC_009428	GAG	2	6	3268	3273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
71	NC_009428	CGA	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
72	NC_009428	TCG	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
73	NC_009428	CGG	2	6	3428	3433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
74	NC_009428	GTC	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
75	NC_009428	CT	3	6	3558	3563	0 %	50 %	0 %	50 %	146276062
76	NC_009428	CG	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
77	NC_009428	GGC	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
78	NC_009428	GGGC	2	8	3636	3643	0 %	0 %	75 %	25 %	146276062
79	NC_009428	GCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276062
80	NC_009428	CGGG	2	8	3682	3689	0 %	0 %	75 %	25 %	146276062
81	NC_009428	GCG	2	6	3694	3699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
82	NC_009428	CG	3	6	3698	3703	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
83	NC_009428	CGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276062
84	NC_009428	CG	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
85	NC_009428	GCC	3	9	3752	3760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276062
86	NC_009428	GCG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
87	NC_009428	GGC	2	6	3864	3869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
88	NC_009428	CTGG	2	8	3883	3890	0 %	25 %	50 %	25 %	146276062
89	NC_009428	GGC	2	6	3919	3924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
90	NC_009428	CGG	3	9	3932	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
91	NC_009428	GCG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
92	NC_009428	CG	3	6	4093	4098	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
93	NC_009428	GGC	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
94	NC_009428	GGC	2	6	4141	4146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
95	NC_009428	GGC	2	6	4153	4158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
96	NC_009428	GTCG	2	8	4186	4193	0 %	25 %	50 %	25 %	146276062
97	NC_009428	GGA	2	6	4198	4203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276062
98	NC_009428	GCG	3	9	4237	4245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
99	NC_009428	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
100	NC_009428	GCT	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276062
101	NC_009428	GC	4	8	4387	4394	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
102	NC_009428	GCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
103	NC_009428	CTG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276062
104	NC_009428	CGA	2	6	4432	4437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276062
105	NC_009428	GGC	2	6	4441	4446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
106	NC_009428	GGC	2	6	4468	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
107	NC_009428	CGA	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276062
108	NC_009428	GC	3	6	4491	4496	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
109	NC_009428	G	6	6	4550	4555	0 %	0 %	100 %	0 %	146276062
110	NC_009428	TCA	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276063
111	NC_009428	TGGGCG	2	12	4649	4660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146276063
112	NC_009428	GGC	2	6	4665	4670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276063
113	NC_009428	GGCTG	2	10	4691	4700	0 %	20 %	60 %	20 %	146276063
114	NC_009428	AGC	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276063
115	NC_009428	AGG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276063
116	NC_009428	CTT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276063
117	NC_009428	GCGCT	2	10	4772	4781	0 %	20 %	40 %	40 %	146276063
118	NC_009428	GGC	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276063
119	NC_009428	CGGGA	2	10	4815	4824	20 %	0 %	60 %	20 %	146276063
120	NC_009428	TCT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276063
121	NC_009428	GGT	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276063
122	NC_009428	CCA	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276064
123	NC_009428	GGT	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276064
124	NC_009428	CGA	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276064
125	NC_009428	CGGTGA	2	12	5321	5332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146276064
126	NC_009428	ATGC	2	8	5392	5399	25 %	25 %	25 %	25 %	146276064
127	NC_009428	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
128	NC_009428	TCA	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276064
129	NC_009428	GGC	2	6	5485	5490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
130	NC_009428	GGT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276064
131	NC_009428	CGC	2	6	5661	5666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276064
132	NC_009428	GCG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
133	NC_009428	TCA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276064
134	NC_009428	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
135	NC_009428	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276064
136	NC_009428	TGC	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276064
137	NC_009428	CAA	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276064
138	NC_009428	CGG	2	6	6003	6008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
139	NC_009428	CACC	2	8	6009	6016	25 %	0 %	0 %	75 %	146276064
140	NC_009428	GC	3	6	6032	6037	0 %	0 %	50 %	50 %	146276064
141	NC_009428	CGA	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276064
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143	NC_009428	CCAG	2	8	6170	6177	25 %	0 %	25 %	50 %	146276064
144	NC_009428	CGG	2	6	6212	6217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
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148	NC_009428	GGC	2	6	6303	6308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
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150	NC_009428	GGC	2	6	6321	6326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
151	NC_009428	GC	3	6	6325	6330	0 %	0 %	50 %	50 %	146276064
152	NC_009428	TCG	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276064
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157	NC_009428	CGA	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276064
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161	NC_009428	CAT	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276064
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165	NC_009428	GGC	2	6	6819	6824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
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169	NC_009428	GGC	2	6	6993	6998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
170	NC_009428	CCGGG	2	10	7018	7027	0 %	0 %	60 %	40 %	146276064
171	NC_009428	TC	3	6	7140	7145	0 %	50 %	0 %	50 %	146276064
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175	NC_009428	CG	3	6	7241	7246	0 %	0 %	50 %	50 %	146276064
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245	NC_009428	TGG	2	6	10615	10620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276067
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249	NC_009428	CGG	2	6	10840	10845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276067
250	NC_009428	GCC	2	6	10950	10955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276067
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252	NC_009428	CAAGGA	2	12	11135	11146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146276068
253	NC_009428	ATC	2	6	11160	11165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276068
254	NC_009428	CCA	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276068
255	NC_009428	GCT	2	6	11216	11221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276068
256	NC_009428	GCC	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276068
257	NC_009428	CGTGAT	2	12	11306	11317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146276068
258	NC_009428	CAC	2	6	11342	11347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276068
259	NC_009428	GAT	2	6	11366	11371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276068
260	NC_009428	CAA	2	6	11462	11467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276068
261	NC_009428	CGG	2	6	11498	11503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276068
262	NC_009428	CG	3	6	11517	11522	0 %	0 %	50 %	50 %	146276068
263	NC_009428	GC	3	6	11573	11578	0 %	0 %	50 %	50 %	146276068
264	NC_009428	TCA	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276068
265	NC_009428	GCT	2	6	11615	11620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276068
266	NC_009428	TCA	2	6	11635	11640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276068
267	NC_009428	GAA	2	6	11705	11710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276068
268	NC_009428	ATC	2	6	11721	11726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276068
269	NC_009428	CGG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276068
270	NC_009428	TGG	2	6	11746	11751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276068
271	NC_009428	CGT	3	9	11861	11869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276068
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273	NC_009428	CTG	2	6	11949	11954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276068
274	NC_009428	CGG	2	6	11995	12000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276068
275	NC_009428	CGA	2	6	12071	12076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276068
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280	NC_009428	CGA	2	6	12238	12243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276068
281	NC_009428	GTG	2	6	12291	12296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276068
282	NC_009428	CGGT	2	8	12312	12319	0 %	25 %	50 %	25 %	146276068
283	NC_009428	GCC	2	6	12394	12399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276068
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287	NC_009428	GTC	2	6	12564	12569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276068
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290	NC_009428	GAC	2	6	12822	12827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276069
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292	NC_009428	TGG	2	6	12856	12861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276069
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